沐川县拥有林地面积161万亩，其中竹林面积81万亩。森林面积140万亩，森林覆盖率达77.34%。有四川芹菜坪自然保护区、四川沐川国家森林公园和四川黄丹省级森林公园，全县各类自然保护地面积14.12万亩。境内动植物资源丰富，种类繁多，植物有157科，961种，国家重点保护植物13种，登记在册古树115株。分布有国家Ⅰ级保护动物5种，即四川山鹧鸪、金雕、金钱豹、林麝、穿山甲；国家Ⅱ级保护动物20种。